北京农民专业合作社股东成员变更登记的流程如下：

1. 合作社股东变更手续，需要向登记机关递交申请书，以及新股东信息等资料。登记机关会将这些信息通报同级农业等有关部门，审核通过后，予以变更。

2. 合作社需要准备《农民专业合作社登记（备案）申请书》、成员大会或者成员代表大会做出的变更决议、法定代表人签署的修改后的章程或者章程修正案等材料。

3. 农民专业合作社变更股东的，还应当提交变更申请、工商审核及验资、向农委备案、财务年度完结增加股东等材料。

4. 登记机关应当自受理登记申请之日起二十日内办理完毕，向符合登记条件的申请者颁发营业执照，登记类型为农民专业合作社。

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