北京公司减少注册资本的登记流程如下：

1. 经股东会决议通过。

2. 修改公司章程。注册资本属于公司章程应当载明的事项，所以在减资的时候要相应修改公司的章程。

3. 编制资产负债表以及财产清单。根据《公司法》第177条规定，公司需要减少注册资本时，必须编制资产负债表及财产清单。 

4. 通知或者是公告债权人。注册资本的减少在一定程度上会动摇公司的资本信用基础，进而影响公司债权人的权利。因此，在减资时需要切实保护债权人的利益。对此，《公司法》第177条规定：公司应当自作出减少注册资本决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。

5. 办理变更登记。

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