林业病虫害防治服务企业资质证书的办理流程包括以下步骤：

1. 提交申请资料，包括填写《林业病虫害防治机构资格认证申请表》，以及提供法人营业执照或法人证书复印件、身份证复印件（法定代表人证明）、经营管理负责人的任职文件、身份证、职称资格证书、学历证书等相关证明文件。

2. 当地林业病虫害防治相关机构对申请资料进行初步审查，并出具备案证明。

3. 评审机构对申请资料进行受理和评审，包括对企业资质、技术人员资格、防治设施和设备、管理制度等方面的审查。

4. 根据评审结果，确定企业的服务能力等级，并在网上公示评审结果。

5. 经过公示无异议后，颁发林业病虫害防治服务企业资质证书。

需要注意的是，不同地区的具体办理流程和要求可能略有不同，许可证申请条件、办理流程、代办费用等服务一站式通办，了解更多相关问题欢迎来电详询！