公司合并注销后，车辆指标过户的处理办法：

1. 需要原公司注销，车辆过户到新公司名下，需要时间拿到新公司的指标，才能办理车辆过户。
2. 车辆过户时需要车辆违章记录全部处理完毕，双方公司出具的指标转移证明材料，携带车主身份证原件及复印件，购车发票、车辆登记证、行车证等手续去车管所办理。
3. 如果合并前已经将车辆转给新公司，那么可以继续使用合并前获得的指标。

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