民办非企业单位改制为有限公司需要经过以下步骤：

决定变更：民办非企业单位的法定代表人或理事会需要先决定将该单位变更为有限公司，并经过民政、教育、卫生等主管部门的审批。

准备材料：变更前需要准备好相关材料，包括单位的法人证书、章程、工商营业执照、税务登记证、组织机构代码证、财务报表、土地使用证等。

公司设立：根据公司设立的相关规定，完成公司设立的相关手续，包括名称预核、股东会议决议、出资等。

股权变更：民办非企业单位的法人代表需要按照出资比例认购公司的股份，将原来的非营利组织变为有限公司。

资产变更：根据有关法律法规，民办非企业单位的资产变更为有限公司的资产，需要进行评估、转让等相关手续。

注销民办非企业单位：民办非企业单位变更完成后，需要进行注销，包括各种组织登记、银行账户、税务等手续。

需要注意的是，民办非企业单位改制为有限公司的具体操作流程可能因地区和实际情况而有所不同。更多问题欢迎来电咨询！