公司变更股东的流程如下：

1. 召开股东大会，形成股东会决议。在会议中通过表决的方式决定由谁来继任公司的股东，并形成决议。

2. 应当自股东决议作出之日起30天内申请变更登记。提交相关材料，比如变更股东的申请书、公司章程、股权转让协议等。

3. 由国家工商局加盖公章的营业执照正、副本，和公司法定代表人签署的股东变更的确认书。

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